3a8ea93e0a59a048d708d224de2f8053e5e47340
[csit.git] / resources / tools / presentation / generator_CPTA.py
1 # Copyright (c) 2018 Cisco and/or its affiliates.
2 # Licensed under the Apache License, Version 2.0 (the "License");
3 # you may not use this file except in compliance with the License.
4 # You may obtain a copy of the License at:
5 #
6 #     http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0
7 #
8 # Unless required by applicable law or agreed to in writing, software
9 # distributed under the License is distributed on an "AS IS" BASIS,
10 # WITHOUT WARRANTIES OR CONDITIONS OF ANY KIND, either express or implied.
11 # See the License for the specific language governing permissions and
12 # limitations under the License.
13
14 """Generation of Continuous Performance Trending and Analysis.
15 """
16
17 import datetime
18 import logging
19 import csv
20 import prettytable
21 import plotly.offline as ploff
22 import plotly.graph_objs as plgo
23 import plotly.exceptions as plerr
24 import numpy as np
25 import pandas as pd
26
27 from collections import OrderedDict
28 from utils import find_outliers, archive_input_data, execute_command
29
30
31 # Command to build the html format of the report
32 HTML_BUILDER = 'sphinx-build -v -c conf_cpta -a ' \
33                '-b html -E ' \
34                '-t html ' \
35                '-D version="Generated on {date}" ' \
36                '{working_dir} ' \
37                '{build_dir}/'
38
39 # .css file for the html format of the report
40 THEME_OVERRIDES = """/* override table width restrictions */
41 .wy-nav-content {
42     max-width: 1200px !important;
43 }
44 """
45
46 COLORS = ["SkyBlue", "Olive", "Purple", "Coral", "Indigo", "Pink",
47           "Chocolate", "Brown", "Magenta", "Cyan", "Orange", "Black",
48           "Violet", "Blue", "Yellow"]
49
50
51 def generate_cpta(spec, data):
52     """Generate all formats and versions of the Continuous Performance Trending
53     and Analysis.
54
55     :param spec: Specification read from the specification file.
56     :param data: Full data set.
57     :type spec: Specification
58     :type data: InputData
59     """
60
61     logging.info("Generating the Continuous Performance Trending and Analysis "
62                  "...")
63
64     ret_code = _generate_all_charts(spec, data)
65
66     cmd = HTML_BUILDER.format(
67         date=datetime.date.today().strftime('%d-%b-%Y'),
68         working_dir=spec.environment["paths"]["DIR[WORKING,SRC]"],
69         build_dir=spec.environment["paths"]["DIR[BUILD,HTML]"])
70     execute_command(cmd)
71
72     with open(spec.environment["paths"]["DIR[CSS_PATCH_FILE]"], "w") as \
73             css_file:
74         css_file.write(THEME_OVERRIDES)
75
76     with open(spec.environment["paths"]["DIR[CSS_PATCH_FILE2]"], "w") as \
77             css_file:
78         css_file.write(THEME_OVERRIDES)
79
80     archive_input_data(spec)
81
82     logging.info("Done.")
83
84     return ret_code
85
86
87 def _select_data(in_data, period, fill_missing=False, use_first=False):
88     """Select the data from the full data set. The selection is done by picking
89     the samples depending on the period: period = 1: All, period = 2: every
90     second sample, period = 3: every third sample ...
91
92     :param in_data: Full set of data.
93     :param period: Sampling period.
94     :param fill_missing: If the chosen sample is missing in the full set, its
95     nearest neighbour is used.
96     :param use_first: Use the first sample even though it is not chosen.
97     :type in_data: OrderedDict
98     :type period: int
99     :type fill_missing: bool
100     :type use_first: bool
101     :returns: Reduced data.
102     :rtype: OrderedDict
103     """
104
105     first_idx = min(in_data.keys())
106     last_idx = max(in_data.keys())
107
108     idx = last_idx
109     data_dict = dict()
110     if use_first:
111         data_dict[first_idx] = in_data[first_idx]
112     while idx >= first_idx:
113         data = in_data.get(idx, None)
114         if data is None:
115             if fill_missing:
116                 threshold = int(round(idx - period / 2)) + 1 - period % 2
117                 idx_low = first_idx if threshold < first_idx else threshold
118                 threshold = int(round(idx + period / 2))
119                 idx_high = last_idx if threshold > last_idx else threshold
120
121                 flag_l = True
122                 flag_h = True
123                 idx_lst = list()
124                 inc = 1
125                 while flag_l or flag_h:
126                     if idx + inc > idx_high:
127                         flag_h = False
128                     else:
129                         idx_lst.append(idx + inc)
130                     if idx - inc < idx_low:
131                         flag_l = False
132                     else:
133                         idx_lst.append(idx - inc)
134                     inc += 1
135
136                 for i in idx_lst:
137                     if i in in_data.keys():
138                         data_dict[i] = in_data[i]
139                         break
140         else:
141             data_dict[idx] = data
142         idx -= period
143
144     return OrderedDict(sorted(data_dict.items(), key=lambda t: t[0]))
145
146
147 def _evaluate_results(in_data, trimmed_data, window=10):
148     """Evaluates if the sample value is regress, normal or progress compared to
149     previous data within the window.
150     We use the intervals defined as:
151     - regress: less than median - 3 * stdev
152     - normal: between median - 3 * stdev and median + 3 * stdev
153     - progress: more than median + 3 * stdev
154
155     :param in_data: Full data set.
156     :param trimmed_data: Full data set without the outliers.
157     :param window: Window size used to calculate moving median and moving stdev.
158     :type in_data: pandas.Series
159     :type trimmed_data: pandas.Series
160     :type window: int
161     :returns: Evaluated results.
162     :rtype: list
163     """
164
165     if len(in_data) > 2:
166         win_size = in_data.size if in_data.size < window else window
167         results = [0.0, ] * win_size
168         median = in_data.rolling(window=win_size).median()
169         stdev_t = trimmed_data.rolling(window=win_size, min_periods=2).std()
170         m_vals = median.values
171         s_vals = stdev_t.values
172         d_vals = in_data.values
173         for day in range(win_size, in_data.size):
174             if np.isnan(m_vals[day - 1]) or np.isnan(s_vals[day - 1]):
175                 results.append(0.0)
176             elif d_vals[day] < (m_vals[day - 1] - 3 * s_vals[day - 1]):
177                 results.append(0.33)
178             elif (m_vals[day - 1] - 3 * s_vals[day - 1]) <= d_vals[day] <= \
179                     (m_vals[day - 1] + 3 * s_vals[day - 1]):
180                 results.append(0.66)
181             else:
182                 results.append(1.0)
183     else:
184         results = [0.0, ]
185         try:
186             median = np.median(in_data)
187             stdev = np.std(in_data)
188             if in_data.values[-1] < (median - 3 * stdev):
189                 results.append(0.33)
190             elif (median - 3 * stdev) <= in_data.values[-1] <= (
191                     median + 3 * stdev):
192                 results.append(0.66)
193             else:
194                 results.append(1.0)
195         except TypeError:
196             results.append(None)
197     return results
198
199
200 def _generate_trending_traces(in_data, build_info, period, moving_win_size=10,
201                               fill_missing=True, use_first=False,
202                               show_moving_median=True, name="", color=""):
203     """Generate the trending traces:
204      - samples,
205      - moving median (trending plot)
206      - outliers, regress, progress
207
208     :param in_data: Full data set.
209     :param build_info: Information about the builds.
210     :param period: Sampling period.
211     :param moving_win_size: Window size.
212     :param fill_missing: If the chosen sample is missing in the full set, its
213     nearest neighbour is used.
214     :param use_first: Use the first sample even though it is not chosen.
215     :param show_moving_median: Show moving median (trending plot).
216     :param name: Name of the plot
217     :param color: Name of the color for the plot.
218     :type in_data: OrderedDict
219     :type build_info: dict
220     :type period: int
221     :type moving_win_size: int
222     :type fill_missing: bool
223     :type use_first: bool
224     :type show_moving_median: bool
225     :type name: str
226     :type color: str
227     :returns: Generated traces (list) and the evaluated result (float).
228     :rtype: tuple(traces, result)
229     """
230
231     if period > 1:
232         in_data = _select_data(in_data, period,
233                                fill_missing=fill_missing,
234                                use_first=use_first)
235     # try:
236     #     data_x = ["{0}/{1}".format(key, build_info[str(key)][1].split("~")[-1])
237     #               for key in in_data.keys()]
238     # except KeyError:
239     #     data_x = [key for key in in_data.keys()]
240     hover_text = ["vpp-build: {0}".format(x[1].split("~")[-1])
241                   for x in build_info.values()]
242     data_x = [key for key in in_data.keys()]
243
244     data_y = [val for val in in_data.values()]
245     data_pd = pd.Series(data_y, index=data_x)
246
247     t_data, outliers = find_outliers(data_pd)
248
249     results = _evaluate_results(data_pd, t_data, window=moving_win_size)
250
251     anomalies = pd.Series()
252     anomalies_res = list()
253     for idx, item in enumerate(in_data.items()):
254         # item_pd = pd.Series([item[1], ],
255         #                     index=["{0}/{1}".
256         #                     format(item[0],
257         #                            build_info[str(item[0])][1].split("~")[-1]),
258         #                            ])
259         item_pd = pd.Series([item[1], ], index=[item[0], ])
260         if item[0] in outliers.keys():
261             anomalies = anomalies.append(item_pd)
262             anomalies_res.append(0.0)
263         elif results[idx] in (0.33, 1.0):
264             anomalies = anomalies.append(item_pd)
265             anomalies_res.append(results[idx])
266     anomalies_res.extend([0.0, 0.33, 0.66, 1.0])
267
268     # Create traces
269     color_scale = [[0.00, "grey"],
270                    [0.25, "grey"],
271                    [0.25, "red"],
272                    [0.50, "red"],
273                    [0.50, "white"],
274                    [0.75, "white"],
275                    [0.75, "green"],
276                    [1.00, "green"]]
277
278     trace_samples = plgo.Scatter(
279         x=data_x,
280         y=data_y,
281         mode='markers',
282         line={
283             "width": 1
284         },
285         name="{name}-thput".format(name=name),
286         marker={
287             "size": 5,
288             "color": color,
289             "symbol": "circle",
290         },
291         text=hover_text,
292         hoverinfo="x+y+text+name"
293     )
294     traces = [trace_samples, ]
295
296     trace_anomalies = plgo.Scatter(
297         x=anomalies.keys(),
298         y=anomalies.values,
299         mode='markers',
300         hoverinfo="none",
301         showlegend=False,
302         legendgroup=name,
303         name="{name}: outliers".format(name=name),
304         marker={
305             "size": 15,
306             "symbol": "circle-open",
307             "color": anomalies_res,
308             "colorscale": color_scale,
309             "showscale": True,
310             "line": {
311                 "width": 2
312             },
313             "colorbar": {
314                 "y": 0.5,
315                 "len": 0.8,
316                 "title": "Circles Marking Data Classification",
317                 "titleside": 'right',
318                 "titlefont": {
319                     "size": 14
320                 },
321                 "tickmode": 'array',
322                 "tickvals": [0.125, 0.375, 0.625, 0.875],
323                 "ticktext": ["Outlier", "Regression", "Normal", "Progression"],
324                 "ticks": "",
325                 "ticklen": 0,
326                 "tickangle": -90,
327                 "thickness": 10
328             }
329         }
330     )
331     traces.append(trace_anomalies)
332
333     if show_moving_median:
334         data_mean_y = pd.Series(data_y).rolling(
335             window=moving_win_size, min_periods=2).median()
336         trace_median = plgo.Scatter(
337             x=data_x,
338             y=data_mean_y,
339             mode='lines',
340             line={
341                 "shape": "spline",
342                 "width": 1,
343                 "color": color,
344             },
345             name='{name}-trend'.format(name=name)
346         )
347         traces.append(trace_median)
348
349     return traces, results[-1]
350
351
352 def _generate_chart(traces, layout, file_name):
353     """Generates the whole chart using pre-generated traces.
354
355     :param traces: Traces for the chart.
356     :param layout: Layout of the chart.
357     :param file_name: File name for the generated chart.
358     :type traces: list
359     :type layout: dict
360     :type file_name: str
361     """
362
363     # Create plot
364     logging.info("    Writing the file '{0}' ...".format(file_name))
365     plpl = plgo.Figure(data=traces, layout=layout)
366     try:
367         ploff.plot(plpl, show_link=False, auto_open=False, filename=file_name)
368     except plerr.PlotlyEmptyDataError:
369         logging.warning(" No data for the plot. Skipped.")
370
371
372 def _generate_all_charts(spec, input_data):
373     """Generate all charts specified in the specification file.
374
375     :param spec: Specification.
376     :param input_data: Full data set.
377     :type spec: Specification
378     :type input_data: InputData
379     """
380
381     job_name = spec.cpta["data"].keys()[0]
382
383     builds_lst = list()
384     for build in spec.input["builds"][job_name]:
385         status = build["status"]
386         if status != "failed" and status != "not found":
387             builds_lst.append(str(build["build"]))
388
389     # Get "build ID": "date" dict:
390     build_info = dict()
391     for build in builds_lst:
392         try:
393             build_info[build] = (
394                 input_data.metadata(job_name, build)["generated"][:14],
395                 input_data.metadata(job_name, build)["version"]
396             )
397         except KeyError:
398             build_info[build] = ("", "")
399
400     # Create the header:
401     csv_table = list()
402     header = "Build Number:," + ",".join(builds_lst) + '\n'
403     csv_table.append(header)
404     build_dates = [x[0] for x in build_info.values()]
405     header = "Build Date:," + ",".join(build_dates) + '\n'
406     csv_table.append(header)
407     vpp_versions = [x[1] for x in build_info.values()]
408     header = "VPP Version:," + ",".join(vpp_versions) + '\n'
409     csv_table.append(header)
410
411     results = list()
412     for chart in spec.cpta["plots"]:
413         logging.info("  Generating the chart '{0}' ...".
414                      format(chart.get("title", "")))
415
416         # Transform the data
417         data = input_data.filter_data(chart, continue_on_error=True)
418         if data is None:
419             logging.error("No data.")
420             return
421
422         chart_data = dict()
423         for job in data:
424             for idx, build in job.items():
425                 for test_name, test in build.items():
426                     if chart_data.get(test_name, None) is None:
427                         chart_data[test_name] = OrderedDict()
428                     try:
429                         chart_data[test_name][int(idx)] = \
430                             test["result"]["throughput"]
431                     except (KeyError, TypeError):
432                         pass
433
434         # Add items to the csv table:
435         for tst_name, tst_data in chart_data.items():
436             tst_lst = list()
437             for build in builds_lst:
438                 item = tst_data.get(int(build), '')
439                 tst_lst.append(str(item) if item else '')
440             csv_table.append("{0},".format(tst_name) + ",".join(tst_lst) + '\n')
441
442         for period in chart["periods"]:
443             # Generate traces:
444             traces = list()
445             win_size = 10 if period == 1 else 5 if period < 20 else 3
446             idx = 0
447             for test_name, test_data in chart_data.items():
448                 if not test_data:
449                     logging.warning("No data for the test '{0}'".
450                                     format(test_name))
451                     continue
452                 test_name = test_name.split('.')[-1]
453                 trace, result = _generate_trending_traces(
454                     test_data,
455                     build_info=build_info,
456                     period=period,
457                     moving_win_size=win_size,
458                     fill_missing=True,
459                     use_first=False,
460                     name='-'.join(test_name.split('-')[3:-1]),
461                     color=COLORS[idx])
462                 traces.extend(trace)
463                 results.append(result)
464                 idx += 1
465
466             # Generate the chart:
467             chart["layout"]["xaxis"]["title"] = \
468                 chart["layout"]["xaxis"]["title"].format(job=job_name)
469             _generate_chart(traces,
470                             chart["layout"],
471                             file_name="{0}-{1}-{2}{3}".format(
472                                 spec.cpta["output-file"],
473                                 chart["output-file-name"],
474                                 period,
475                                 spec.cpta["output-file-type"]))
476
477         logging.info("  Done.")
478
479     # Write the tables:
480     file_name = spec.cpta["output-file"] + "-trending"
481     with open("{0}.csv".format(file_name), 'w') as file_handler:
482         file_handler.writelines(csv_table)
483
484     txt_table = None
485     with open("{0}.csv".format(file_name), 'rb') as csv_file:
486         csv_content = csv.reader(csv_file, delimiter=',', quotechar='"')
487         line_nr = 0
488         for row in csv_content:
489             if txt_table is None:
490                 txt_table = prettytable.PrettyTable(row)
491             else:
492                 if line_nr > 1:
493                     for idx, item in enumerate(row):
494                         try:
495                             row[idx] = str(round(float(item) / 1000000, 2))
496                         except ValueError:
497                             pass
498                 try:
499                     txt_table.add_row(row)
500                 except Exception as err:
501                     logging.warning("Error occurred while generating TXT table:"
502                                     "\n{0}".format(err))
503             line_nr += 1
504         txt_table.align["Build Number:"] = "l"
505     with open("{0}.txt".format(file_name), "w") as txt_file:
506         txt_file.write(str(txt_table))
507
508     # Evaluate result:
509     result = "PASS"
510     for item in results:
511         if item is None:
512             result = "FAIL"
513             break
514         if item == 0.66 and result == "PASS":
515             result = "PASS"
516         elif item == 0.33 or item == 0.0:
517             result = "FAIL"
518
519     logging.info("Partial results: {0}".format(results))
520     logging.info("Result: {0}".format(result))
521
522     return result